柯南现在住在博士家，但是他实在控制不住自己那看到案件就蠢蠢欲动想探案的心。
而且案件那么多，毛利大叔和目暮警官他们也忙不过来，他偶尔帮忙处理一下。
阿笠博士是知道他就是工藤新二，灰原哀也知道，但是毛利小五郎和毛利兰不知道，只以为柯南是阿笠博士家的远房亲戚。
因为他住在阿笠博士家，加上出众的侦探才能，再次被少年侦探团招募加入了其中。
只是他现在不住毛利家，不能经常靠近小兰了。
这一次放假，他装乖装可爱接近小兰，陪她和毛利大叔一起去参加冲野洋子的早安七点直播。
冲野洋子的朋友水无怜奈遇到了困扰，每周六早上六点半会有人按她家门铃，她马上开门出去，却看不到人。
他跟着一起去看看，顺便在她家门口装了发信器和窃听器，看能不能帮忙查到是谁。
最后查出来是个六七岁的小孩子，以为水无怜奈没有出现在早安七点直播的电视里，是因为睡过头了，所以每次周六小学放假了，六点半来按门铃叫她起床去录电视。
水无怜奈有每天晚上把书籍垃圾堆在门口，第二天出门带走的习惯，小学生按完门铃就躲到高高叠起来的书后，所以她找不到人。
解决完案件，他忘记回收发信器和窃听器，关门时口香糖掉下来，被水无怜奈踩在了脚底下。
让他不小心听到了，着名的日迈电视台女主播居然是黑衣组织的成员，代号基尔酒。
他这次真的不打算再去追查黑衣组织，他只想回收窃听器，如果被黑衣组织发现的话，那么昨天和早上都在水无怜奈家的，毛利侦探将会成为第一个被怀疑的对象。
按照组织的作风，毛利一家甚至身边的人，都可能会遭到暗杀。
他拿到水无怜奈的鞋子，但是没有成功回收。
而且他们也成功暗杀了土门康辉。
基安蒂，科恩。
又多了两个代号成员，他们到底有多少人！
刚才水无怜奈摸着他脖子上的颈动脉，问他有没有在跟踪他，那是……测谎的动作。
她应该察觉他在说谎，但是放过了他，为什么？
现在最重要的是赶紧回收东西。
乌丸垣完成任务，和琴酒等人回了基地。
“巴罗洛！！！”基安蒂回到基地就激动地大喊着巴罗洛的名字，“你在2000码开外，狙击了土门康辉！2000码啊！”
她本以为他早上的1600码是极限了，没想到出任务时，直接给她上强度，作为狙击手，尽管她的性格是泼辣不服输的。
但是碰到个2000码的大佬，她绝对心服口服。
她平时出任务，都喜欢跟科恩抢人头，因为两人半斤八两，她喜欢K头。
今天原本是安排她出手，科恩同她打配合的，琴酒临时更换狙击手，如果是别人，她肯定不服。但是早上巴罗洛刚给她秀了一手1600码爆头盛宴，她没有什么不服的，轻易同意了调整计划。
没想到正式任务时，巴罗洛居然说在2000码的狙击点开枪的，并且准确爆头。
2000码，子弹到达都要两三秒钟，这两三秒是很容易发生突发状况，导致任务失败的，但是他成功了，而且一枪毙命。
她简直快崇拜死他了，虽然巴罗洛是个小鬼头，但是不妨碍他强，她慕强魂都燃起来了。
“巴罗洛的极限狙击距离是2500码！”伏特加托大哥的福在车上听了一嘴，自觉比基安蒂他们优越，得意的开口。
“2500码！？真的假的？我不信，打给我看看！”
“想看。”科恩一向没有表情的脸上又泛起了可疑的红晕，这是他激动的表现。
“就是真的！哼！”伏特加不服，我大哥都信，你凭什么不信！
“……”乌丸垣回到基地一句话没说，被基安蒂和科恩围着，吧啦吧啦输出，主要是基安蒂在输出。
他现在不想装哔……今天装太多次了，有点累了。
“下次吧，下次吧。”乌丸垣挥挥手拒绝。
水无怜奈那边因为土门康辉是当她面被狙击的，她作为目击证人，被带到警视厅去了。
柯南也跟去了，他借着身子小溜进去了，想找机会收回窃听器。
摸到水无怜奈录口供的房门口，他该怎么拿回东西呢？
他偷偷找了佐藤警官帮忙，让她借口需要搜身来排除水无怜奈的嫌疑，帮他把鞋子拿出来。
他回来一个多月，又和少年侦探团一起帮助这些警察破了不少案子，尽管佐藤警官非常疑惑他的行为，但是大部分和他交好的警官大多数时候，都愿意配合他。
水无怜奈身上是带着针孔摄像头的，就在她左胸口别着的胸针，“警官该不会怀疑我是那个狙击手吧？为什么要搜身？”
“额，只是为了排除你的嫌疑，我们当然知道你和土门先生没有任何龃龉，没有作案动机，这只是一个流程，不代表我们怀疑你。”佐藤也有点尴尬，说实话水无怜奈也算是受害者，约了采访结果被采访者被当她面爆头了。
作为女主播恐怕要留下心理阴影了，当场被吓哭，但是柯南那个小子不知道要干什么，找她帮忙搜身。
水无怜奈没办法，人家说只是流程，心里没鬼肯定不怕搜身，她再拒绝会有点可疑。
她只能期望组织的黑科技不是他们的技术能探查出来的，如果被发现，她就说是电视台给的摄像头，为了更全面的录制这次的个人采访。
佐藤偷偷把水无怜奈的鞋子拿给了柯南，柯南马上抠下了鞋底的口香糖，把鞋子还给了佐藤。
佐藤看到口香糖瞪了他一眼，偷偷给水无怜奈送回去了，“没有问题，你的口供录完了，后续如果还有需要配合调查的，可能还需要麻烦你跑一趟哈。”
“好的。”水无怜奈保持微笑，心里松了一口气。
柯南在水无怜奈出来时，躲了起来，看着她远去，他的表情凝重。
这件事他不能声张，即使他知道暗杀土门先生的凶手是谁，但是他没有证据，窃听器只有监听功能，没有保留录音的功能，他没有证据，而且只说几个代号，并不能代表证据去逮捕。
他甚至还不知道基安蒂，科恩都是什么样子的。
琴酒和伏特加，他倒是知道，他在新干线有和两人正面撞上过。
琴酒是一头银色长发，很高挑，鼻子很大很踏，长相有点老气，皮肤有点皱，法令纹很深，苹果肌很发达，长相可以说有点难看。（动画第五集有）
伏特加很壮，法令纹也很深，脸颊凹陷，有点肥头大耳，长得也很难看。
他已经答应了爸爸妈妈不再去追查组织的事，了。
这些事情，他只能自己记在心里，水无怜奈代号基尔，克丽丝代号贝尔摩德。
之前好不容易遇到一个朱蒂老师，是FbI的探员刚好也在调查组织的事，可是她很快就死在了组织手里，如果他可以和朱蒂老师合作一起调查的话，他有朝一日，说不定真的可以摧毁组织。